Los proyectos utilizan dos sistemas de base:

Plataforma de moléculas para la modulación de la expresión génica.

Nedken busca integrar moléculas producidas sintéticamente dentro del mecanismo de RNAi o de antisentido de microRNAs (sistema de tráfico, comunicación y modulación celular) evitando la reacción del organismo y generando los menores efectos secundarios para el tratamiento. Para ello, cuenta con un file application que protege la modificación de oligonucleótidos con azúcares y está ampliando con tres provisionals, nuevas modificaciones químicas para la especificidad de tejido y células.
El sistema de síntesis y validación de moléculas se diseñó como una plataforma que permite desarrollar fármacos dirigidos a cualquier órgano o célula del cuerpo, en forma de molécula simple o como un cóctel que module selectivamente un gen objetivo (target) o un grupo de genes asociados a una enfermedad.
Además, por su diseño, la probabilidad de éxito posterior a que las características básicas de la molécula sean ajustadas respecto de la toxicidad y biodisponibilidad es muy elevada, permitiendo avanzar más rápidamente en fases preclínicas y clínicas.
LA ENTIDAD BASE DE LA PLATAFORMA DE MOLÉCULAS ESTÁ EN PROCESO DE PATENTAMIENTO, PERMITIENDO A NEDKEN INICIAR CONVERSACIONES DE LICENCIAMIENTO O CODESARROLLO PARA FINES DE 2008.

Plataforma de evolución de péptidos y proteínas: vacunas peptídicas sintéticas (basadas en MHC).

Siguiendo el modelo de procesamiento de antígenos (vía del Complejo Mayor de Histocompatibilidad o MHC) se identifican los péptidos generados en el procesamiento de antígenos por las células presentadoras de antígeno, y utilizando métodos bioinformáticos, se simulan las posibilidades evolutivas de los organismos infecciosos. Luego, por métodos químicos se producen los componentes de la vacuna, incorporando modificaciones químicas específicas que incrementan su inmunogenicidad y sus propiedades farmacogénicas.

ESTA TÉCNICA, QUE UTILIZA ELEMENTOS INFORMÁTICOS PARA LA SIMULACIÓN, Y ENSAYOS DE LABORATORIO PARA LA VALIDACIÓN DE LOS CANDIDATOS SINTÉTICOS, SE LANZARÁ A FINES DE 2008.